Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rdm1Q9CQK3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rdm1Q9CQK3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms