Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snrpb2Q9CQI7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpb2Q9CQI7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snrpb2Q9CQI7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snrpb2Q9CQI7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms