Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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Trappc5Q9CQA1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc5Q9CQA1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc5Q9CQA1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc5Q9CQA1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc5Q9CQA1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Trappc5Q9CQA1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc5Q9CQA1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc5Q9CQA1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Trappc5Q9CQA1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc5Q9CQA1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Trappc5Q9CQA1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc5Q9CQA1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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Trappc5Q9CQA1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc5Q9CQA1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc5Q9CQA1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Trappc5Q9CQA1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc5Q9CQA1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Trappc5Q9CQA1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc5Q9CQA1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Trappc5Q9CQA1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc5Q9CQA1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Trappc5Q9CQA1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Trappc5Q9CQA1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Trappc5Q9CQA1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Trappc5Q9CQA1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc5Q9CQA1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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