Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA0

Cenpm, Centromere protein M, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpmQ9CQA0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CenpmQ9CQA0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CenpmQ9CQA0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms