Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp2Q9CQ73 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp2Q9CQ73 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms