Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpa3Q9CQ71 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpa3Q9CQ71 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms