Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudcd2Q9CQ48 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd2Q9CQ48 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms