Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms