Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska1Q9CPV1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms