Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT5

Nop16, Nucleolar protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop16Q9CPT5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop16Q9CPT5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nop16Q9CPT5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop16Q9CPT5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop16Q9CPT5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop16Q9CPT5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop16Q9CPT5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop16Q9CPT5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop16Q9CPT5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop16Q9CPT5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop16Q9CPT5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop16Q9CPT5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop16Q9CPT5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.6 ms