Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt88Q9CPR6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms