Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm3Q9CPP0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms