Protein–RNA interactions for Protein: Q99PB1

1700020D05Rik, Mage-g2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700020D05RikQ99PB1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700020D05RikQ99PB1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700020D05RikQ99PB1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700020D05RikQ99PB1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700020D05RikQ99PB1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700020D05RikQ99PB1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700020D05RikQ99PB1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700020D05RikQ99PB1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700020D05RikQ99PB1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700020D05RikQ99PB1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700020D05RikQ99PB1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700020D05RikQ99PB1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700020D05RikQ99PB1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700020D05RikQ99PB1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700020D05RikQ99PB1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700020D05RikQ99PB1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms