Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl43Q99N89 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl43Q99N89 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms