Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cadm3Q99N28 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms