Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hdac9Q99N13 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac9Q99N13 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms