Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms