Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SrrtQ99MR6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms