Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkd1Q99MH6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkd1Q99MH6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkd1Q99MH6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkd1Q99MH6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkd1Q99MH6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkd1Q99MH6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkd1Q99MH6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkd1Q99MH6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkd1Q99MH6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkd1Q99MH6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkd1Q99MH6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkd1Q99MH6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkd1Q99MH6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkd1Q99MH6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkd1Q99MH6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkd1Q99MH6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkd1Q99MH6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms