Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smtnl1Q99LM3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smtnl1Q99LM3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms