Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnpo2Q99LG2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms