Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp16Q99LG0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms