Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms