Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apobec3Q99J72 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms