Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctu1Q99J10 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.1 ms