Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b5Q923D4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms