Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx18Q91ZR2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms