Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde6cQ91ZQ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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