Protein–RNA interactions for Protein: Q91YT2

Rnf185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf185Q91YT2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf185Q91YT2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf185Q91YT2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms