Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rrp1bQ91YK2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrp1bQ91YK2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms