Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg13Q91YI1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg13Q91YI1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg13Q91YI1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg13Q91YI1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg13Q91YI1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg13Q91YI1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg13Q91YI1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg13Q91YI1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg13Q91YI1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms