Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdhb12Q91Y07 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms