Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms