Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Klc3Q91W40 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Klc3Q91W40 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Klc3Q91W40 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Klc3Q91W40 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Klc3Q91W40 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Klc3Q91W40 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Klc3Q91W40 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klc3Q91W40 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klc3Q91W40 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klc3Q91W40 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klc3Q91W40 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klc3Q91W40 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klc3Q91W40 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klc3Q91W40 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klc3Q91W40 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klc3Q91W40 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms