Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps3Q91VB4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms