Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDJ3

Hdlbp, Vigilin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdlbpQ8VDJ3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HdlbpQ8VDJ3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HdlbpQ8VDJ3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms