Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt25Q8VCW2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt25Q8VCW2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.5 ms