Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
BbxQ8VBW5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 505.9 ms