Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT1

Txlnb, Beta-taxilin, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnbQ8VBT1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TxlnbQ8VBT1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TxlnbQ8VBT1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TxlnbQ8VBT1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 338.5 ms