Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms