Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c5Q8R2T8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf3c5Q8R2T8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms