Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim29Q8R2Q0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim29Q8R2Q0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms