Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms