Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sumf1Q8R0F3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms