Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hecw1Q8K4P8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hecw1Q8K4P8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms