Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Rdh16f2Q8K3M1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Rdh16f2Q8K3M1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
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Rdh16f2Q8K3M1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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Rdh16f2Q8K3M1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Rdh16f2Q8K3M1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Rdh16f2Q8K3M1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
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Rdh16f2Q8K3M1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Rdh16f2Q8K3M1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Rdh16f2Q8K3M1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh16f2Q8K3M1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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