Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
OptnQ8K3K8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OptnQ8K3K8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms