Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd2Q8K2Z4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms