Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Abcf3Q8K268 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms