Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300eQ8K249 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300eQ8K249 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300eQ8K249 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300eQ8K249 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300eQ8K249 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300eQ8K249 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300eQ8K249 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300eQ8K249 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300eQ8K249 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300eQ8K249 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300eQ8K249 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300eQ8K249 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300eQ8K249 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300eQ8K249 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300eQ8K249 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300eQ8K249 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300eQ8K249 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300eQ8K249 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300eQ8K249 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms